發病原因：發病原因尚未完全清楚，下列各因素與發病有關。
1.解剖因素 小兒骶尾骨彎度小，直腸較垂直，腹內壓增高時，直腸缺乏支持而易於脱垂。直腸前陷凹腹膜反折過低，腹內壓增高和腸袢壓迫使直腸前壁突入直腸壺腹導致脱垂。老年人肌肉鬆弛，生育過多或分娩時會陰撕裂亦可使直腸發生脱垂。
2.腹內壓增高 長期便祕、腹瀉、慢性咳嗽和排尿困難等引起腹內壓增高，可導致直腸脱垂。近年來國外研究發現，直腸脱垂常伴有精神或神經系統疾患，兩者間的關係目前尚不清楚，有人認為神經系統病變時，控制及調節排便的功能發生障礙，直腸慢性擴張，對糞便刺激的敏感性減弱，從而產生便祕和控制排便能力下降。排便時異常用力，使肛提肌及盆底組織功能減弱，也是直腸脱垂的常見原因。
3.其他 外傷、手術引起腰骶神經麻痺，致肛管括約肌鬆弛，引起直腸黏膜脱垂。
