由下丘腦一垂體一卵巢軸中的某一環節發生功能或器質性病變引起。按引起閉經的病變部位,可分為子宮性、卵巢性、垂體性和下丘腦性閉經。
子宮頸、陰道、處女膜、陰脣等處,有一段先天性閉鎖,或後天損傷造成粘連閉鎖,雖然有月經,但經血不能外流,這種情況稱為隱性或假性閉經。生殖道下段閉鎖,經過醫生的治療,是完全可以治癒的。
子宮內膜不能發生週期性的變化,也就不會出現子宮內膜脱落,所以也就沒有月經來潮。也有的先天性無子宮,或子宮內膜發育不良,或子宮內膜損傷,即使卵巢功能健全,雌激素和孕激素的分泌正常,也不會來月經。
引起下丘腦功能失調的原因很多,如精神刺激、悲傷憂慮、恐懼不安、緊張勞累,以及環境改變、寒冷刺激等。由下丘腦引起的閉經比較多見。