手術危險性極低，成功率在99%以上，與闌尾切除術相當。手術後遠期效果好，與正常人一樣。常見的紫紺先心病 如法樂四聯症的危險性也不高。其它的複雜先心病 的手術成功率90%以上。非常複雜先心病手術後多數也能達到生活自理。一般輕微的先心病手術後照樣養兒育女，甚至有許多複雜畸形矯治術後，在醫師的指導下一樣妊娠分娩。
心胸醫院專家指出：先心病不經治療，到一歲時有一半死亡，到兩歲時三分之二死亡。並且畸形越複雜，病情越重死亡越多，死亡越早。嬰幼兒期病情進展快，如室間隔缺損等左向右分流的病例，易併發肺動脈高壓。併發輕到中度肺動脈高壓時，尚可爭取手術治療，但當發展到重度肺動脈高壓時，則失去了手術機會，不能進行手術治療。因此，早發現，早診斷，早治療是降低先心病自然死亡率及手術死亡率，提高手術治療效果的關鍵。不同的病種手術的最佳時機不同，但總的原則是儘早。
在先心病的分類中，簡單先心佔到了總比例的80%以上，對於先心病的治療，年齡因素的考慮是一方面，更主要的還是根據病變類型、病情發展和對孩子發育狀況的影響等綜合考慮。在這個問題上，一定要聽從專科醫生的建議。目前，臨牀上對簡單先心的治療主要有以下3種方式：
外科開胸手術是主要治療手段。傳統的外科開胸手術治療是主要治療方式，它一般適用所有簡單先天性心臟病及複雜先天性心臟病，例如：合併肺動脈高壓的先天性心臟病、法樂氏四聯徵以及其他有紫紺現象的心臟病。
相對於其他手術方式，開胸手術費用較低，住院時間7-10天左右，但手術創傷較其他方式大，術後恢復較慢。目前上海遠大心胸醫院已為近12000例先心患兒進行心外科修補手術。
介入封堵的特點為創傷小適應症嚴格。介入封堵手術是近幾年發展起來的一種新型微創治療，它依靠齊全的設備、先進的導管室、技術熟練精湛的專科醫師，主要適用於動脈導管未閉、房間隔缺損及部分室間隔缺損不合並其他需手術矯正的畸形患兒。#p#副標題#e#
介入封堵治療相對併發症少，創傷小，無須開胸手術，恢復快，患者痛苦小，住院時間3天左右，但它有較嚴格的適應症，費用相對外科手術要高。當然，隨着醫學技術的日臻成熟，介入封堵的手術適應症也會進一步擴大。
外科微創封堵的特點是外科與介入的結合。外科微創封堵術也是近兩年興起的新技術，它不需要開胸，而是在右胸前部胸骨切2-3釐米的小口，置入推送器，在心臟超聲的引導下，釋放封堵器將缺口堵住。平均手術時間不超過1個小時，患者手術當天就能下地活動，住院3-4天。適用於部分房間隔缺損、室間隔缺損和動脈導管未閉的患者。
胸腔鏡下心臟手術的特點為恢復快、住院時間短，胸腔鏡下治療先天性心臟病，上海遠大心胸醫院心外科程雲閣主任將胸部小切口手術技巧與胸腔鏡技術相結合，通過改進手術方法、改良手術器械，左右胸壁打3個1到2釐米的孔，進行體外循環胸壁打孔胸腔鏡下治療先天性心臟病室間隔缺損、室間隔缺損，該手術方法無骨胳損傷，不用切斷肌肉。這種手術雖然操作難度較大，但適應症廣且創傷小。患者術後住院時間短，恢復快，費用低。而且胸壁上僅有三個鑰匙孔樣的小孔，無大的切口保持美觀。胸腔鏡手術後當天患者即可下牀活動。
嬰兒先天性心臟病外科開胸手術、介入封堵手術、外科微創封堵手術、胸腔鏡下心臟手術各自特點如上，在先天性心臟病治療中可根據具體情況靈活運用。
由於科技的進步，目前嬰幼兒先心病外科治療，手術成功率在百分之九十五以上。有大約四分之一的病兒在出生第一年內都需藥物治療或開刀。值得注意是需要治療的先心病兒中有四分之三以上可以外科矯治。由於各醫院的設備及技術水平不一，手術年齡掌握也有所不同。但先心病等到3歲以後再手術的觀點肯定已經過時了。在此，希望患兒家屬面對現實，不要對自愈抱太大的希望，儘早尋求醫師治療，臨牀經常見到因此而延誤治療的病例。也希望醫務人員給與正確引導。
