《掃黑風暴》終於迎來大結局，督導組和掃黑辦聯手將中江省綠藤市的毒瘤拔除，高明遠等人受到應有的懲罰，李成陽等來了光明，他迴歸警隊，與林浩成爲搭檔，而林浩也跟黃希修成正果，兩人還有了孩子，不少人表示結局有點倉促，感覺很多東西都沒有演出來。
董耀和陳建波將高明遠讓他們殺害麥自立並埋屍的事情向警方交代清楚，可是高明遠矢口否認，他堅持說自己不認識麥自立，更沒有殺人。高明遠以爲自己還有一線生機，就是不肯認罪伏法，直到鄭毅紅和王政被抓，他才知道自己徹底沒救了。
隨着八通大廈爆破，羣衆支持掃黑除惡的聲音越來越大，舉報信紛至沓來，督導組對這些案件進行分類彙總，摸清高明遠犯罪集團的組織脈絡和成員關係，十四年前的真相也被揭開。
高明遠被判處死刑，鄭毅紅和陳建波等人也受到應有的懲罰，所有參與麥自立案、馬帥案和薛梅案的人都落網，他們終究逃不過法律的審判，李成陽前往庭審現場，親眼目睹高明遠等人的全部審判過程。
爲高明遠犯罪集團充當保護傘的王政、賀芸和武雙嶺等人被另案處理，孫興再也沒有以前囂張跋扈的神情，他很悔恨和痛苦，直到被執行死刑也沒有見到賀芸，賀芸說她不恨孫興，但永遠也不會原諒孫興。
李成陽重新穿上了警服，回到了自己原來的崗位，曾經他和林漢是搭檔，十四年後，他又和林浩成爲搭檔，最後李成陽跟餛飩店老闆娘京京重逢，兩人走到一起，而林浩和黃希也結婚生子，很多網友表示林浩和黃希發展太快了，因爲劇裏他們沒有多少感情戲。
