女性月經週期以月經見紅第一天為週期的開始，週期的長短因人而異，約為 21-35 天不等，平均約為 28 天，其中又以排卵日為分隔，分為排卵前的濾泡期與排卵後的黃體期。濾泡期長短不一定，但黃體期固定約為 14 天上下兩天。
排卵後次日，因卵巢形成黃體，分泌黃體素會使體温上升攝氏 0．6 度 左右，而使體温呈現高低兩相變化。高温期約持續 12-16 天 （ 平均 14 天 ）． 若無懷孕， 黃體萎縮停止分泌黃體素，體温下降，回到基本線，月經來潮。若是已經懷孕，因黃體受到胚胎分泌荷爾蒙支持，繼續分泌黃體素，體温持續高温。若卵巢功能不良，沒有排卵也沒有黃體形成，所以體温將持續低温。
女性不孕症患者，常常先要進行基礎體温測定，以初步判斷是否有排卵，以及黃體功能是否健全。如果婦女基礎體温持續升高超過16天，則有可能受孕，若持續20天不降，完全可以診斷早孕。
還有，原因不明的閉經婦女，通過基礎體温的測定，能大致查出病變所在。如基礎體温呈雙相，説明體內性激素水平正常，病變很有可能為子宮內膜受損所致；若為單相型，即在後半期體温不升高，則表示病變部位可能在卵巢、垂體或丘腦。
檢查目的
處於生育年齡正常排卵期的女性，由於受卵泡期、黃體期不同雌孕激素的影響，基礎體温呈雙相改變，根據排卵後基礎體温升高速度、幅度及高温持續的時間，可以初步瞭解有否排卵及排卵後黃體功能情況。
如果黃體功能水平低，卵子就不容易着牀，而且容易流產。 檢查方法 每天清晨醒來，不説話不做事，將放於牀頭的體温計放入口腔中進行測量，並記錄下測量的體温。這樣，從這次月經到下次月經之間，每天早晨測量基礎體温，記錄一個月的基礎體温曲線圖。在特殊的日子，如感冒、發燒等問題，要做好特殊記號。一個月後，將所得的曲線交給醫生，讓她來考慮如何處理。
