腦血栓後遺症是伴着腦血栓而來，所以只要確定了腦血栓，便可以診斷。腦血栓形成除了與出血性腦血管病鑑別外，還需與腦栓塞、TIA鑑別。此外，也要與其他顱腦疾病如顱內佔位性病變、腦瘤、硬膜下血腫、腦膿腫、腦炎、腦寄生蟲病等鑑別。但根據病史及檢查，常不難鑑別。
應與以下疾病鑑別：
（一）腦出血
發病更急，常有頭痛，嘔吐等顱內壓增高症狀及不同程度的意識障礙，血壓增高明顯，典型者不難鑑別。但大面積梗塞與腦出血，輕型腦出血與一般腦血栓臨牀症狀相似，鑑別困難，往往需要做CT才能鑑別。
（二）腦栓塞
起病急驟，一般缺血範圍較廣，症狀常較重，常有心臟病史，特別是有心房纖顫、細菌性心內膜炎、心肌梗塞或其它掀因容易產生栓子來源時應考慮腦栓塞。
（三）顱內佔位性病變
某些硬膜下血腫、顱內腫瘤、腦膿腫等發病也較快，出現偏癱等症狀，與腦血栓相似，應注意有無高顱壓的症狀及體徵，必要時可做腰穿、CT等檢查以資鑑別。
腦血栓的治療可以採取家庭治療法：腦血栓後遺症的治療，傳統的治療方法是靠臥牀休息、藥物治療，所以使大部分腦血栓後遺症患者失去了康復痊癒的機會，永久性的留下了肢體殘疾甚至死亡，所以一定要走出腦血栓後遺症的治療誤區。
腦血栓後遺症病人由於留有持久的肢體殘廢和語言障礙，生活質量明顯下降，常需家屬陪伴和照顧，他們渴望得到治癒的心情是完全可以理解的。那麼，腦血栓後遺症是否還能治好呢？一般來說，腦血栓後遺症治好的可能性不大，藥物治療收效甚微。
腦血栓後遺症所引起的偏癱和語言障礙等，經過一年的治療仍無改善的症狀，即爲腦血栓後遺症。隨着醫學科學的進步，急性期能夠挽救生命的患者增多，腦血栓後遺症的病人也相應增加。而且，往往是年齡越大，高血壓、動脈硬化時間越長，發作次數越多，併發症越多，則後遺症越重、越多。
對腦血栓後遺症病人，切實可行的治療應該是認真查找危險因素，採取措施預防疾病復發，並在醫生指導下進行治療性鍛鍊，對抗肌肉痙攣、關節攣縮，防止肌肉廢用性萎縮和關節強直，爭取殘存功能的最好發揮。
腦血栓患者還可以採取腦通疏絡寧栓療法：“腦通疏絡寧栓療法”治療系統是在中醫基礎理論指導下，結合現代科技發展的產物，綜合應用中醫理論、生物醫學工程、計算機技術、信息與傳感器技術等，而研發出具有中醫特色的智能化、規範化診療設備。使療效達到客觀化、標準化水平，且無副作用，治療腦血栓、腦梗塞、腦供血不足取得了顯著療效，治療有效率達93.8%，充分反映了現代中醫治療“腦通疏絡寧栓療法”的優越性。
最後，腦血栓患者的心情也是影響病情的重要因素。要時刻保持積極、開朗的心態，坦然面對，一切都不是問題。
