1、生殖道感染較爲常見。近年來隨着性傳播疾病發病率的提高，生殖道炎症如前列腺炎、睾丸炎、附睾炎、尿道炎的發病率和嚴重程度有所增加，嚴重影響男性的生育能力。
2、內分泌疾病。原因是促性腺激素缺乏。常見的有選擇性促性腺功能低下型性機能減退，即Kallmann氏綜合徵；選擇性LH缺陷症和FSH缺陷症；腎上腺皮質增生症；高泌乳素血癥等。
3、輸精管道梗阻。影響精子的輸送。
4、染色體異常。常見的有男性假兩性畸形、克氏綜合徵和XYY綜合徵。
5、男性性功能障礙。陽痿、早泄、不射精和逆行射精皆可引起男性不育。
6、睾丸生精功能異常。
a、常見於隱睾，精索靜脈曲張，毒素、磁場、高熱和外傷等理化因素皆可引起睾丸的生精障礙。
b、鞘膜積液：鞘膜積液壓迫了睾丸血液循環，可導致睾丸感染或萎縮。該病青春期後發病率爲16%—19%。
c、睾丸後天損傷：如疝氣修補術、鞘膜積液手術、睾丸固定手術等損傷了睾丸血管，阻礙血供而使睾丸萎縮。
7、精子結構異常和精漿異常。影響精子的運動、獲能和頂體反應等。
8、免疫性不育。男性自身產生的抗精子免疫和女性產生的抗精子同種免疫均可引起男性不育。
正常的精子可引起精子自身免疫的因素有：
a、睾丸外傷或外科手術。
b、輸出管道(如附睾、輸精管)梗阻。
c、老年時睾丸退行性變。
d、睾丸和附屬性腺(特別是前列腺和精囊)的感染。
這引起因素均可引起精子抗體與自身免疫系統接觸，T細胞致敏和產生睾丸炎。對精子抗原的自體免疫或同種免疫，至少有兩種機制引起不育：
a、干擾發生過程，引起無精症或少精症。
b、通過抗體對精子在正常生育有中的作用產生不育影響。
