乳腺增生病病變組織的大體標本爲，病變呈瀰漫性或侷限性，質地硬韌而緻密，色黃白或灰白，無包膜，切面可見有多個大小不等的半透明顆粒;如爲囊性增生，則可見到小囊腫，囊壁大都平滑，囊內含有黃綠色或棕色的粘稠液體，有的還有顆粒狀物或乳頭狀物向囊腔內突出。
乳腺增生病在病理上，一方面表現爲乳腺導管的囊性擴張，形成大小不等的囊腫;另一方面表現爲導管上皮有不同程度的乳頭狀增生，小葉內和小葉間纖維組織也有不同程度的增生。
由於乳腺增生病的組織形態複雜，所以其組織學分類方法也多種多樣。如有學者依乳腺結構在數量和形態上的異常將其分爲乳腺組織增生、乳腺腺病（又分爲小葉增生期、纖維腺病期及纖維化期）、乳腺囊腫病三大類;也有的學者依乳腺增生的基本組織改變將其分爲小葉增生、纖維化、炎性、囊腫、上皮增生、腺病6種類型。也正是由於其組織形態學上的複雜性，所以才造成了本病命名上的混亂性，如小葉增生症、慢性乳腺炎、纖維囊性乳腺病、良性上皮增生症、腺病等。
乳腺增生病按導管上皮增生的形態可將其分爲四級：
Ⅰ級：不伴有導管上皮增生，此級發生率爲70%;
Ⅱ級：伴有導管上皮增生，但上皮細胞不呈異型性，其發生率爲20%;
Ⅲa級：伴有導管上皮增生，上皮細胞呈輕度異型性，發生率爲5%;
Ⅲb級：伴有導管上皮增生，上皮細胞呈重度異型性，發生率爲5%，此級惡變率最高，可能惡變率爲75%～100%。
