餵食母乳，並非所有的疾病均不宜，有部分嬰兒或母體即使患病也是可以進行哺乳的。只要應當注意一些有關事項而已。
嬰兒脣顎裂常給餵養母乳帶來不便，此種情況可將乳汁擠入小杯內，用湯匙、注射器等餵食。若舌系過短，過緊，可讓大夫剪開繫帶後餵養。腹瀉引起嬰兒輕度脫水時，母親應當間斷吸奶器吸出乳汁。鵝口瘡用制黴菌素有可靠有療效，治癒後不影響母乳餵養。嬰兒若出現母乳性黃疸，只要不是病理性的，膽紅素《340mol/L，仍可母乳餵養，一般兩個月後自行消失，對嬰兒發育無不良影響。一般性的發熱、上呼吸道感染等，也不影響哺乳，不宜停止餵奶，以防回乳。
母體的部分疾病不影響餵養嬰兒。部分乳房疾病，如乳頭平坦、肉陷，應先擠奶，使乳暈變軟，再伸展乳頭周圍皮膚及牽拉乳頭，堅持一段時間即可正常。乳頭皸裂應糾正嬰兒的姿勢。嚴重的乳頭皸裂可用複方安息香酸酊塗搽患處，也可用白礬加蜂蜜蒸後外用，影響餵奶時可暫時擠出奶汁餵養。輕度的乳腺炎不影響哺乳，因爲炎症是在乳房結締組織，而不是乳腺管，乳汁不會帶菌。
除此之外，輕度的糖尿病可行母乳餵養。因哺乳本身有抗糖尿病的作用，即使是母親在服藥期間，對嬰兒也無大的影響。
需要指出的是，母親在使用有損嬰兒的藥品時應少喂或者儘可能不喂，激素類藥物、部分抗生素（如四環素氯黴素、紅黴素、鏈黴素、磺胺類等）、鋰鹽、阿司匹林、嗅隱亭、抗癲癇藥、抗甲狀腺藥等，對嬰兒均有一定的影響，應避免服用。
