確定致病基因；用於攜帶者檢出和產前診斷；並可預測抑制物的產生。
（一）直接基因診斷：採用分子生物學方法（PCR，DGGE，SSCP，DNA測序等）直接測定致病基因的缺陷。FVIII 22內含子倒位分析可作爲重型HA的篩選試驗，也是目前唯一用於臨牀診斷的直接基因檢測方法。FVIII 22內含子倒位和其它一些基因突變常伴有抑制物發生，因此有助於預測抑制物的產生。
（二）間接基因診斷：利用致病基因內外的限制性片段長度多態性（RFLP）作爲特異分子遺傳標誌物，通過家系成員間的連鎖關係確定血友病基因的遺傳情況，進行DNA多態性分析的遺傳學診斷（RFLP，VNTR，STR等方法），可使診斷率達99%。RFLP分析的侷限性：必須具有先證者的標本；母親系該多態位點的雜合子，聯合多個RFLP纔可診斷。
（三）產前診斷：對高危胎兒可在妊9-12周通過絨毛膜活檢;妊12-16周進行養水穿刺，近來還可在胚胎植入前通過早期胚胎（8個細胞時）獲取胎兒DNA，通過DNA基因型和遺傳表型確定胎兒性別，以及進一步判斷是否爲血友病或攜帶者。妊18-20周可在胎兒鏡下取臍靜脈血，測定FVIII:C和FVIII:Ag。上述方法都存在流產的危險（約0.5%-1%）， 需在婦產科醫生的指導與配合下進行。利用流式細胞術（FACS）測定母體靜脈血中的胎兒特異性單克隆抗體以確定胎兒性別，提供了早期，無創性產前診斷的方法。
