廣泛應用抗結核藥物治療以來，肺結核管道播散的併發症，如喉、腸結核已很少見。
1.氣胸 肺內空洞及乾酪樣病變靠近胸膜部位破潰時，可引起結核性膿氣胸。粟粒型肺結核偶可引起雙側自發性氣胸。
2.支氣管內膜狹窄 由支氣管內膜病變引起。
3.支氣管擴張 肺結核病竈反覆進展及纖維化，致使肺內支氣管正常結構遭受破壞，可引起繼發性支氣管擴張，常反覆咯血。常位於上肺葉，稱乾性支擴。可致致死性大咯血。
4.膿胸 滲出性胸膜炎的胸水，如未及時治療，亦可逐漸乾酪化甚至變爲膿性，成爲結核性膿胸。是乾酪性及空洞性肺實質性結核感染進展的結果，常發生在氣胸之後，伴有衰竭及對感染的抵抗力喪失。
5.肺麴菌病 在結核空洞中常見。咯血爲本病的主要死亡原因。
6.慢性肺源性心臟病 重症肺結核引起肺組織廣泛破壞所致。慢性纖維空洞型肺結核或一側肺毀損，併發肺氣腫、肺大皰，可引起自發性氣胸，亦可導致慢性源性心臟病，甚至心肺功能衰竭。
原發性感染時結核菌隨血行分佈，潛伏在其他器官，一旦人體免疫力極度減弱，可產生該器官的結核病，常見的有淋巴結、腦膜、骨及泌尿生殖器官結核等。
艾滋病容易繼髮結核菌或非結核分枝桿菌感染，有些發達國家結核病疫情原已顯著下降，但由於艾滋病的流行，卡氏肺孢子蟲、鉅細胞病毒感染以及結核病患者有所增多。而發展中國家在人體免疫缺陷病毒（HIV）感染及艾滋病患者中，主要併發症是結核菌感染，常見的是原有的陳舊性結核病竈復烯（內源性復發）。同時患有肺結核與艾滋病，其診斷困難，療效差，病死率高。
