腦積水原因多樣，如腦室內脈絡叢產生和分泌腦脊液正常，而腦脊液的流通受阻，成爲梗阻性腦積水;那腦積水的成因是什麼呢?
相關資料指出，胎兒腦積水的原因與遺傳因素有關外，自60年代以來，環境因素中的病毒(風疹病毒、鉅細胞病毒、單純皰疹病毒等)和弓形體原蟲的宮內感染，已日益爲人們所重視，感染對孕婦本身所致的症狀雖較輕，但對胚胎的發育影響較大，可導致胎兒流產、死胎、死產和多種嚴重的先天性畸形，其中弓形蟲感染，可致胎兒產生導水管狹窄的腦積水畸胎。
另外，在胎兒腦積水的原因中，早孕期放射線、放射元素、微機、手機等輻射因素與腦積水的形成有一定的關係。可初步推測腦積水畸胎是由遺傳因素和環境因素共同作用所致的多因子遺傳性疾病。爲了減少劣生和提高人口健康素質，除應採取病因研究外;還應進行婚前檢查;嚴禁近親婚配;開展遺傳諮詢。
腦積水病因很多，常見的有以下幾種原因：
１)感染：胎兒宮內感染如各種病毒、原蟲和梅毒螺旋體感染性腦膜炎未能及早控制，增生的纖維組織阻塞了腦脊液的循環孔道，或胎兒顱內炎症也可使腦池、蛛網膜下腔和蛛網膜粒粘連閉塞。
２)先天畸形：如中腦導水管狹窄、膈膜形成或閉鎖，室間孔閉鎖畸形(第四腦室正中孔或側空閉鎖)，腦血管畸形，脊柱裂，小腦扁桃體下疝等。
