板藍根主治溫毒所致的疾病，如流感、上呼吸道炎症、流腦、腮腺炎、急性腸炎、菌痢、肝炎、顏面丹毒、熱病發斑等。雖然藥理研究表明，板藍根對多種病毒與病菌有明顯的抑制作用，但不要忘記它是一味苦寒藥物。所以，對於上述疾病，只有出現溫熱、熱毒、溼熱內盛證候時，才能使用。筆者根據資料分析結合臨牀實踐，歸納出板藍根五項應用指徵爲：
1．時行熱病、高熱神昏。
2．痰熱鬱肺，咳痰黃稠。
3．肝膽溼熱，二便不利。
4．瘡癤癰毒，紅腫熱癰。
5．突然吐衄，血色鮮紅。
凡出現上述任何一項，兼見舌紅苔膩，脈數有力者，均可選用板藍根治療。
若出現以下五種病症者，要慎用之。
1．體質素虛，經常感冒者。
2．慢性胃腸炎患者。
3．低血壓、精神不振者。
4．過敏體質者。
5．患血液系統疾病者。
其他如患有胃下垂、消化性潰瘍、甲狀腺機能減退、心律失常等疾病，也要慎用。近年來，有關板藍根所致的過敏反應，如消化系統、造血系統不良反應已有不少報道。過敏反應表現爲頭昏、眼花、胸悶、氣短、嘔吐、腹瀉、腹痛、面色青紫、四肢麻木，或皮疹等，嚴重者還可以引起過敏性休克，甚至危及生命。
