1.新生兒大便不通有以下幾種原因：
①先天性單純性肛門閉鎖或直腸閉鎖。該病症是由於胎兒發育過程形成的先天性畸形者，在肛門口覆蓋一層透明薄膜。
②先天性小腸閉鎖及小腸狹窄。該病患兒的症狀表現爲哭鬧不寧(腹痛)、嘔吐及不排胎糞;同時腹脹、腹壁出現腸形和腸蠕動波，並出現脫水及休克危象。屬於急危症，一經診斷應立即施行外科手術治療。
2.新生兒便祕症有以下幾種原因：
①先天性肛門閉鎖或直腸閉鎖伴發直腸陰道瘻、直腸膀胱瘻，直腸會陰痿等先天性畸形者，如果其痿口狹小，易造成新生兒患慢性便祕症。
②先天性肥厚性幽門狹窄症。其症狀表現爲持續性噴射狀嘔吐、頑固性便祕症、腹部可見胃蠕動波、體重銳減、而容憔悴、皮膚枯乾、皮下脂肪消失、皮膚無彈性等。病情進展極爲嚴重，一經診斷應儘早施行手術。
③先天性巨結腸症。
④呆小病。即新生兒甲狀腺功能減退症，出生後即發生便祕症。患兒表現爲體溫偏低，少活動，少哭笑，反應遲鈍，呆滯，昏沉欲睡，食慾不振，經常性便祕等。
