【併發症】
假如急性腎盂腎炎診斷、治療及時，則很少出現併發症。併發於有潛在腎臟病或尿路畸形的急性腎盂腎炎的預後相對較差，而且致病菌常有耐藥性，如不去除腎結石，尤其是合併感染的結石，否則腎盂腎炎難以控制。併發於尿路梗阻的感染也很難治癒，常演變爲慢性過程，並可導致菌血症。
急性腎盂腎炎最嚴重的併發症是中毒性休克。產氣型腎盂腎炎是一種很少見但可致命的腎盂腎炎，通常見於糖尿病患者，由致病菌（常是大腸桿菌的某一菌株）釋放氣體進入感染組織所致。
在得到充分治療後，又無其他腎臟疾病或尿路畸形，急性腎盂腎炎通常可痊癒，並不引起腎臟瘢痕或持續性腎臟損害，相反在腎臟未完全發育成熟的嬰幼兒，尤其是併發於腎臟疾病或尿路畸形的急性腎盂腎炎，常引起持續腎臟損害和瘢痕。
【鑑別診斷】
因爲胰腺炎和急性腎盂腎炎疼痛的部位和性質相似，因此急性腎盂腎炎有時可誤診爲胰腺炎。血清澱粉酶升高，尿液檢查正常有助於胰腺炎的確診並可排除急性腎盂腎炎。
基底部肺炎是一種引起肋下疼痛的發熱性疾病，但其疼痛有胸膜炎性質，胸部X線檢查有異常表現。
有時急性闌尾炎、膽囊炎、憩室炎等急腹症必須與急性腎盂腎炎相鑑別，儘管早期的症狀和體徵相似，但尿液分析和其他實驗室檢查有助於鑑別診斷。
女性急性盆腔炎患者須與急性腎盂腎炎相鑑別。體格檢查發現有特徵性體徵和尿液培養陰性提示急性盆腔炎。
在男性患者，急性腎盂腎炎須要與急性前列腺炎、急性附睾睾丸炎相鑑別。
急性腎盂腎炎還須與腎膿腫、腎四周膿腫鑑別。
