（1）骨髓檢查可用於造血系統疾病的診斷，如對白血病的鑑別診斷，對各種貧血的鑑別診斷、多發性骨髓瘤和血小板增加或減少性疾病的診斷。
（2）某些感染性疾病，如感染性心內膜炎時的骨髓培養有助於提高該病診斷的陽性率，在瘧原蟲和黑熱病原蟲感染時，骨髓檢查有助於發現原蟲並明確診斷。
（3）某些惡性腫瘤時，骨髓檢查可以確定是否有骨髓轉移，因爲骨髓是許多惡性腫瘤轉移的好發部位，肺癌、乳腺、胃癌、前列腺癌易發生骨髓轉移，骨髓檢查可發現相應的腫瘤細胞。
（4）用於骨髓幹細胞培養、染色體核型檢查、骨髓細胞免疫學分型試驗等。
