抗甲狀腺藥物治療一般維持1年半至2年，具體劑量則需按病情的輕重進行調整。有些患者服藥後，一直不願到醫院複查，認爲自己怕熱、乏力、多食、情緒不穩等症狀已經改善，就擅自減少服用量或者“想當然”停藥。其實，這些做法都是不可取的。
正確減量
經過藥物治療後，如果甲亢症狀緩解或血甲狀腺激素水平恢復正常，可以每2～4周減量一次，待症狀完全消除，甲狀腺腫大、突眼等體徵明顯好轉，才能減至最小量維持治療。在完全停藥前，如有必要，還可將維持量再減半。
患者最好定期去醫院複查，瞭解藥物的療效或副作用，除非有比較嚴重的不良反應，一般不宜擅自中斷治療。
如果怕熱、多汗、多食等症狀緩解而甲狀腺腫大或突眼體徵反而惡化，可在醫生指導下，酌情減少抗甲狀腺藥物的服用量，並加用“左旋甲狀腺素片”或“幹甲狀腺片”。
據觀察，大於1年半的“長程”治療，輕、中度甲亢治癒率爲60%;小於6個月的“短程”治療，其治癒率爲40%。
安全停藥
甲亢的病因很多，最常見的是自身免疫性甲狀腺疾病(如格雷夫斯病)。患者去醫院做血液檢查，會發現報告單中“甲狀腺刺激性抗體(TSAb)”呈陽性。服用抗甲狀腺藥物，雖然能在2～3個月內讓甲狀腺功能恢復正常，但是，TSAb轉爲陰性卻需要較長時間。患者如果想停藥，必須滿足一定的“安全條件”：
甲亢症狀緩解，甲狀腺縮小，血管雜音消失，突眼症狀改善。
甲狀腺功能恢復正常，TsAb轉爲陰性。
療程足，藥物維持劑量小。
