妊娠期婦女用藥有時可產生不良影響，據報道，靜脈滴注大劑量四環素治療患腎盂腎炎的孕婦，可引起暴發性肝臟代償失調症候，死亡率很高。腎盂腎炎患者腎功能減退，四環素清除率下降，藥物本身對腎臟又有毒性作用，還可使孕婦發生壞死性脂肪肝、胰腺炎和腎損害，加上四環素對胎兒也有不良影響，因此妊娠期禁用四環素。妊娠後期應用紅黴素十二烷基硫酸鹽引起阻塞性黃疸併發症的可能性增加，可逆的肝臟毒性反應的發生率高達10%~15%。
爲保證胎兒生長的需要和維持母體良好的營養，在孕婦營養不足的情況下，應適當補充鐵、鈣、葉酸鹽、維生素B1和B6，世界衛生組織提出在鉤蟲病和血吸蟲病高發區和對貧血孕婦應常規補充鐵。
