在新婚年輕夫婦中，常發生女方不知已懷孕而又服用了避孕藥的事。那麼，避孕藥對胎兒會不會有影響?這是他們很關心的事。
據國外報道，近年來女孩的陰道癌發生率有所增加，是由於這些患病女孩的母親在孕期服用過雌激素所致。
因此得出結論：婦女在妊娠期間服用雌激素可能影響到下一代的女性嬰兒，使其陰道癌的發病率有所增加。口服避孕藥大都含有孕激素和少量雌激素，如果妊娠早期服了避孕藥，這樣的胎兒最好是不要。因爲妊娠以後5周，胚胎性腺開始發育，避孕藥中的雌激素和孕激素，對胎兒性器官的發育會產生不利影響。
目前已知性激素對胎兒和新生兒皆有不良影響，有毒性，也致畸，可致癌。但是口服避孕藥是否會對遺傳和後代產生不良影響，一直是研究重點。
有人認爲口服避孕藥會增加染色體畸變率，尤其是染色體斷裂率會顯著增高。不過也有資料顯示，孕前或孕時曾服用過避孕藥者與未用藥者的畸胎率比較，兩組無甚差別。關於口服避孕藥對子代的影響，尚有爭論。
鑑於目前中國廣泛採用的短效避孕劑量僅爲原始劑量的1/4，一般認爲還是相當安全的。由於目前對長期服藥對胎我和的遠期影響還沒有足夠的把握，爲了慎重起見，絕大多數人主張以停藥半年以後再懷孕爲好。
