1、子宮頸或內膜粘黏
在進行人工流產時，如果醫師的手法太過粗魯，就很有可能導致子宮頸或內膜受傷、發炎，就有可能產生術後的子宮頸或內膜粘黏、並會引起月經異常，如無月經或月經量過少。嚴重者會在以後產生不育症的情況。
2、子宮頸受傷
在人流的過程，如果不小心，擴張宮頸口的速度太快，都有可能造成子宮頸的損傷，並造成以後懷孕較容易流產的情形，尤其是第一次懷孕或尚未生育過的婦女比較容易發生。
3、子宮穿孔
妊娠週數愈大，危險機率愈高，流產次數愈多，穿孔機會也愈大。其它如子宮位置、形狀異常或以前動過手術的子宮皆有較大的穿孔機會。
4、不完全流產
如果手術施行不完全，少量胎兒組織殘留於子宮內，可能影響子宮收縮而造成持續出血或造成粘黏、感染等情況。要再仔細做一次手術清除殘餘的組織。子宮的位置或形狀不正常，一般比較容易造成此後遺症。
5、細菌感染
如果器械消毒不完全，或是手術者本身未注意無菌過程，即可能造成子宮內感染，甚至繼續往上傳染侵犯輸卵管及骨盆腔，嚴重時會造成以後宮外孕或不孕的後果。
