如果在糞便經過肛門時肛門部有刺痛感，同時伴有滴血，血色鮮紅，且量不多，用手分開肛門可看見放射狀的裂口，就可以認爲是患了初期肛裂。如果初期肛裂經久不愈，經常發作，便後疼痛時間延長呈週期性和間歇性，大便排出困難，肛門部裂口變深並有外痔者，那就患了陳舊性肛裂了。
爲了提高診斷的準確性，防止失誤，應嚴格按照問診、觸診、視診、指診及活體組織檢驗幾個方面來加以鑑別診斷。
視診：牽開臀部可見肛裂下端，觸痛；慢性肛裂常見有結締組織外痔。
指診：因括約肌痙攣、肛門收緊，如用力過猛，常引起劇烈疼痛，須在局麻下檢查，肛門內摸到裂口。
肛鏡檢查可見潰瘍面或破裂口，嚴重肛裂者裂口底可見到括約肌纖維。
另外，須與結核性潰瘍、梅毒潰瘍、軟下疳（性病）和上皮癌等潰瘍相鑑別。
