肛瘻是指肛管直腸與肛門周圍皮膚相通出現的一種病理性管道的疾病，通常是肛周膿腫破潰後形成。
影響正常排便功能的因素很多，包括糞便的質地，直腸的容積，肛直腸部的感覺、反射，肛管的張力及恥骨直腸肌和肛管外括約肌之神經系統的健全程度等，凡影響上述機制的平衡，即能引起肛門失禁，臨牀上可因括約肌損傷、結腸疾病、神經系統疾病、先天性疾病和其他疾病引起肛門失禁。
肛瘻由原發性內口﹑繼發性外口和瘻管組成。內口爲肛周膿腫原發病竈，大多在肛管齒線處的肛竇內，外口是膿腫自然破潰或醫生手術切開的刀口久不癒合處，如果肛瘻日久反覆發作，常不止一個外口。內外口之間由瘻管相通，瘻管是膿腫破潰後膿液從外口排出膿腔逐漸閉鎖形成的纖維化管道。由於大多數肛瘻內口爲一凹陷或肉芽高起，管道一般較細，所以很少有大便從外口排出。
肛瘻的臨牀表現是局部反覆流膿、久不收口，當外口閉合膿液積聚時會疼痛，或有發熱等，由於經常流膿刺激皮膚會出現肛門瘙癢，檢查時可觸及或探及條索通到直腸。治療目前以手術爲主。
由於肛周膿腫的部位和深淺不同，形成的肛瘻也就有高位和低位之別，低位肛瘻的管道穿越外括約肌淺部以下，手術時損傷此處也不會影響肛門的收縮功能，高位肛瘻其管道在肛管直腸環平面以上，手術時一次切斷該環就會肛門失禁。
爲了避免發生肛門失禁，深部間隙的肛周膿腫可分期手術，即先切開排膿，不會損傷重要的肌肉，待炎症消退後，形成了高位肛瘻再採用切開掛線法，在處理高位肛瘻時就會盡可能保持肛門的功能，一般不會造成肛門失控。
