病人在醫院經常需要做肝功能檢查，如病人住院前需要檢查肝功及乙肝表面抗原，各種手術前需要檢查肝功及乙肝表面抗原，此外，做氣管鏡、胃鏡、腹腔鏡、結腸鏡、十二指腸引流等，檢查前都需要檢驗肝功及乙肝表面抗原。
這主要是爲了做好消毒隔離工作。例如，胃鏡是個高級醫療器械，又不太好徹底消毒，如果檢查前不查肝功及乙肝表面抗原，可造成人爲的相應交叉感染。
如果檢查肝功異常，可暫停做胃鏡，待肝功能恢復正常後再做；若發現是乙肝表面抗原陽性，可改用固定式胃鏡做，這樣便於消毒。
另外，有些藥物對肝臟有損害。可在服藥前及眼藥後定時查肝功，以觀察藥物的毒性反應，以便及時停藥或換其他藥物。當然，任何懷疑肝臟有疾患的病人，一般都要檢查肝功能。
