近年來，眼藥水的濫用到了比較嚴重的程度，產生了一些不良後果。
抗生素類眼藥水：這類眼藥水主要有氯黴素、氧氟沙星、諾氟沙星、託百士等。它們主要用於眼部細菌感染性疾病，如細菌性結膜炎、角膜炎等，還可在眼部手術前後短時間用藥，預防細菌感染。但是對於一些非感染性眼病，如各種物理、化學因素引起的慢性結膜炎（表現爲輕微的眼癢、眼睛發紅、異物感、少量的分泌物等）、乾眼症（表現爲眼睛乾澀、異物感等）等，則不需要使用抗生素類眼藥水。如果長期使用的話，往往會適得其反。
在正常的眼瞼、結膜囊等眼表面部位有多種微生物（主要是細菌，也可有真菌、病毒等）定居、生長和繁殖，在醫學上稱之爲“正常菌羣”，它們對保持人體生態平衡和內環境的穩定有重要作用。如果長期濫用抗生素眼藥水，一方面殺死了正常細菌，破壞了眼部的生態平衡，可能導致一些疾病的發生；另一方面，使細菌對藥物產生耐藥性，等到眼部發生細菌感染，需要使用抗生素時，這些藥物都無效了。
激素類眼藥水：這類藥品主要有可的鬆、科恆（的確當）、碘必殊、帕利百等。
它們是眼科最常用的藥物之一，主要用於治療眼部非感染性炎症，如眼部手術後的炎症、葡萄膜炎等，對於一些眼部感染性疾病，在使用大劑量敏感抗生素的同時，在醫生的密切觀察下，也可少量使用。這類藥物有一些共同特點，可降低眼部的抵抗力，使眼部的細菌、病毒等感染病情加重，長期使用可能引起激素性青光眼、激素性白內障等眼病，所以這類藥物應在醫生的指導下使用，每半個月檢查一次眼壓，切不可自己到藥店購買，盲目使用。
防治近視類眼藥水：學生的學習負擔沉重，近視眼的發病率持續上升是社會的普遍現象，也是家長最爲關心的問題，因此防治近視眼的眼藥水也就十分暢銷。許多家長不惜花費大量金錢，只要聽誰說哪種眼藥水好，就買來用，結果是得不償失，長期使用還會產生一些藥物的副作用。
眼保健類眼藥水：“電腦終端性眼病”主要表現爲眼睛酸脹、乾澀、輕微的異物感。當眼睛疲勞時，雖然眼藥水滴上去當時會有一種清涼的感覺，讓人覺得舒適，但這終究是一種對症治療，只是暫時性的緩解眼睛的不適。而這種不適，只要我們在工作和學習中稍加註意，不要長時間注視顯示器，適當休息，是可以避免和恢復視覺疲勞的。
在眼球的表面有一薄層由淚液形成的淚膜，它對眼球表面有溼潤、保護和營養的作用。
