一般說來，從受孕日(受精日)開始的大約3個禮拜期間，這時期所使用的藥，一般都不會對胎兒造成影響。不過，從懷孕2個半月到4個月初期爲止，是胎兒身體器官形成的時期，在這段時期，有時候會因爲所服用的藥量和種類因素，而引起胎兒身體畸形的危險。
在胎兒身體器官大致形成的懷孕4個半月以後，就沒有造成畸形之疑慮，不過，卻可能會影響胎兒各器官的發育。妊娠後，孕婦各個系統和器官均發生了一些變化，使許多藥物在體內的過程非但不同於非孕期，而且還能通過胎盤到達胎兒體內，影響胎兒，或通過乳汁影響新生兒。
因此，近年來對於孕婦用藥已引起了廣泛的重視。藥物對胎兒、新生兒的影響，取決於藥物的種類、劑量、持續作用時間以及通過胎盤的速度和程度，特別取決於胎兒的發育處於什麼階段及其藥物的反應。
在給孕婦用藥時，必須考慮到藥物對胎兒、新生兒的影響：
1 致畸：孕婦用藥引起胎兒畸形，多發生於妊娠12周以內，而以8周內影響最大。此期，胎兒正處於胚胎相繼分化和聯合階段，各系統尚未完全形成，如妊娠早期，使用某些種類的抗早孕反應藥(如安定、氯丙嗪等)，某些保胎的激素類藥(雌激素等)，部分抗生素(氯黴素、抗滴蟲藥、卡那黴素等)，可能導致胎兒畸形。
2 致癌：目前已證實乙烯雌酚和乙烷雌酚有致癌作用。有報導，用過乙烯雌酚保胎的婦女所生女孩中，有0.14-1.4%成長到12-24歲之間，可能發生陰道透明細胞癌。此外，還可能引起流產、死胎和發育畸形。
3 發育缺陷：孕早期口服四環素，可能引起小肢體畸形，孕16周後用藥，可致牙質發育不全或骨質發育遲緩、乳牙發黃。
4 呼吸抑制：嗎啡、哌替啶，可抑制新生兒呼吸中樞，甚至死亡;利血平可引起新生兒鼻塞而導致呼吸困難。以上用藥，在胎兒娩出前1小時儘量不要應用。
5 溶血：部分新生兒，尤其是早產兒，紅細胞對某些藥物的溶血反應敏感。凡能引起肝功能破壞，以及引起溶血和促使血漿蛋白與膽紅素分離的藥物，均可致新生兒黃膽和腦核黃疸。故妊娠晚期，應慎用磺胺藥，人工合成的水溶性維生素K等藥物。
新的化學合成藥物不斷問世，根據有關資料報道，對胎兒有影響的藥物已達百種以上。孕期用藥，應該既照顧到孕婦健康的需要，又要考慮到胎兒的影響，要全面衡量，慎重考慮，既不可濫投藥物，不顧影響，也不能顧此失彼，因噎廢食。
