胃食管反流病有幾個不同的類型，分別是非糜爛性反流病（即只有症狀，內鏡顯示食管沒有異常）、糜爛性食管炎，以及Barrett食管（食管的遠端，也就是連着胃的一端，本來應該是鱗狀上皮，卻變爲柱狀上皮，內鏡檢查可以發現）。
目前的研究顯示，這幾個類型中，唯一可能與食管癌有關的是Barrett食管。
不過，即使胃鏡顯示是Barrett食管，也不一定就會轉變爲食管癌，還要進行病理活檢，來判斷這些“變形的食管上皮”的特性。當食管上皮出現特殊類型腸化，即食管上皮變得和腸道上皮相似，且達到了Ⅲ型，就是一種癌前病變。這類上皮發生高度異型時，即被認爲是早期食管腺癌，要考慮手術治療。而除此之外的無特殊類型腸化的Barrett食管，也只是一種良性病變，通常只需隨訪。
至於其他類型的胃食管反流病，比起一般人，並沒有顯示會增加食管癌的發生概率。當然，胃食管反流病本身還需要一段時間的規範治療，才能減少反覆。
