方劑中的木香、黃連具有清熱、解毒、燥溼、行氣、止痛、健脾止瀉等功能，常用於治療溼熱下注所引起的紅白菌痢、腸炎、腹瀉、腹痛等症。現代醫學研究證明黃連及木香都對痢疾桿菌及其它腸道致病菌具有明顯的抑制及殺滅的作用。因此，在臨牀上常用香連丸來治療痢疾，腸炎及腹瀉等症。
加味香連丸是在香連丸方劑的基礎上加入白頭翁、秦皮、黃芪、黃柏、白芍、黃芩、當歸、枳實等味藥。白頭翁、秦皮、黃芩、黃連、黃柏等具有很好的清熱、降火、解毒，消炎的作用。這些藥對腸道致病菌，特別是疾疾桿菌有較強的殺滅作用，加之黃芪能扶正、祛邪、當歸、枳實能破瘀生新除積滯，因此由這些藥配伍而成的加味香連丸不僅能治療痢疾，而且對腸炎、結腸炎、阿米巴痢疾、腹瀉病等也有較好的治療作用。
