肛瘻是臨牀常見病，多發病。根治方法是手術治療。在臨牀，若使手術成功並獲得滿意的臨牀效果，選擇術式十分重要。
1、掛線法與切開掛線法 掛線法主要適用於低位肛瘻，對於高位肛瘻最好採用切開掛線法。其方法:探針從外口通過瘻管，一端從內口探出後，沿探針切開皮膚，把事先浸泡消毒好的橡皮筋用絲線結紮在探針另一端小球上，由內口拖出探針和一半橡皮筋，將橡皮筋兩端收攏，收攏時用力要適度，既不要太緊，更不能太鬆。用止血鉗夾住勒緊的橡皮筋。用絲線在止血鉗下方雙結紮橡皮筋。對於內口在肛管直腸環以上，或主管通過外括約肌深層以上的高位肛瘻，可切開肌管直腸環以下的全部組織，用探針通過內口把橡皮筋掛在肛管直腸環上，使該處的肛管直腸環被絞勒在橡皮筋內，一般橡皮筋在術後7～10天脫落。若術後7天橡皮筋鬆動而未脫落，可再勒緊結紮1次。若術後10天被絞勒的肛管直腸環僅剩少許組織未斷開，不必再緊橡皮筋，剪斷這少許組織，取下橡皮筋，不會引起肛門失禁。
掛線法自明代開始使用以來，至今已有500年的歷史。這一療法具有簡便、經濟、療效可靠，不影響肛門功能、瘢痕小的優點，幾乎所有的肛瘻均可採用。但我們認爲，對於比較淺的低位肛瘻，不如肛瘻切開術更加徹底、簡便、易行。因此，該方法最好實施於某些肛管直腸環未纖維化的高位肛瘻和深部肛周膿腫的病人。
2、肛瘻切開術 該手術適用於全部低位肛瘻，包括低位單純性肛瘻和低位複雜性肛瘻，以及部分肛管直腸環已纖維化的高位肛瘻。其方法:一手食指伸入肛內，另一手持探針從外口伸入瘻管，按瘻管走行方向輕輕探查，仔細尋找內口，使探針一端順利的從內口探出，沿探針切開，並向外延長切口約1cm，然後修剪創緣，使切口成爲較平坦的創口，以利於引流。該手術成敗的關鍵，除了徹底敞開瘻管外，還在於正確尋找內口，絕大多數肛瘻內口位於齒線處的肛竇內，有的易於尋找，探針一端能順利的通過瘻管從內口探出，但有的病例在術中要找到真正的內口也並不是一件容易的事情。因此，術中可參考索羅門定律(具體內容略)。另外，指檢時內口處往往凹陷或有硬結。用有鉤探針仔細探查可疑的肛竇口往往變深，有的可深入0.5cm以上，極個別病例，可在肛內置入一塊卷好的鹽水紗布塊，再用1%亞甲藍溶液從外口注入，如紗布着色，其內口就在紗布着色處相對應的部位。
絕大多數肛瘻採用切開術均能治癒，即使對肛管直腸環已纖維化的高位肛瘻，此手術仍安全有效。但對肛管直腸環未纖維化的高位肛瘻禁用此手術，因爲完全切斷肛管直腸環，勢必造成肛門失禁。對於這樣的病例必須配合掛線法。
3、部分管道縫合內口引流術 此法適用於外口距肛門較遠的低位肛瘻和低位蹄鐵形肛瘻。其方法:用探針查清管道的走向和內口後，把內口和管道全部切開，然後對切開的管道徹底搔刮，切除外口及其周圍的硬結，適當的修剪管壁，使之成爲一個新鮮創面，切口的外側端予以全層間斷縫合，一般只需3～4針，至肛緣外2～3cm爲止。切口內側端開放。予以引流，術後每日換藥，若無感染，6～7天拆線，未縫合的開放創口繼續引流，直至癒合。
部分管道縫合內口引流術，若縫合部分不感染，可以明顯的縮短傷口癒合時間，對治療蹄鐵形瘻的確是一個好方法，遺憾的是，肛門周圍這個特殊的部位易於感染，若縫合部位感染，將使手術失敗。我們用開窗術來取代它，既可以達到縮短傷口癒合時間的目的，又可以消除縫合後感染 的危險，對於蹄鐵形肛瘻，有些學者主張採用管道完全切開的弧形切口，但由於弧形切口太長，兩側創緣向外張開，彼此間距離又太大，且多不在一個平面上，創緣內低外高，不易一期癒合，爲避免上述弊病，我們採用了開窗術。通過多年的臨牀實踐，證明效果是良好的。
4、內口切開管道開窗術 此術簡稱開窗術。此手術由我科衣先榮同志首先在全國採用，最早應用於肛周膿腫手術上，後來引用到肛瘻手術上，它主要適用於蹄鐵形肛瘻。其方法:用探針查明內口和管道之後，首先從內口開始，由內口向肛外作一放射狀切口，然後在外口處沿瘻管走行方向切開瘻管外側端，長約2～3cm，此切口即爲開窗。開窗切口與先作的放射狀切口之間保留一段正常皮膚，即皮橋。對皮橋下面的瘻管用刮匙徹底搔刮，使其成爲皮下隧道，術終時內口切開處的放射狀切口放置一個引流條，皮下隧道及開窗處也放置一個引流條，分別予以引流。根據外口的數目可開一個窗，也可開兩個窗，蹄鐵形肛瘻最好左右各開一個窗。該手術術後換藥至關重要，術後3～5天內，隧道下放置引流條，之後，隧道上停止引流。每日換藥時在皮橋上面放置摺疊好的小紗布墊，以寬膠布用力加壓固定，使皮橋與下面的組織粘連癒合，皮下隧道徹底消失，這樣就使一個較大的傷口變成二個或三個小切口，即開窗處切口與內口切開處放射狀切口，各切口分別引流直至痊癒。
以上手術，其成敗的關鍵在於正確地找到內口並予以切開。若手術失敗，往往是內口找的不準確，其次是術後換藥不正確。使皮膚過早癒合，殘留死腔所致。
